诊断的第一步是临床检查，按照患者的主诉，发现和寻找患者畸形的部位、表现和症状、畸形发生的时间长短等。但仍有许多症状和表现，需要借助各种医疗器械和仪器对患者进行更详细的检查，以便进一步分析畸形的原因、造成畸形的机制，为诊断收集足够的可用资料。

第二步是对所收集的资料进行分析、归类，明确患者存在的所有畸形问题并对这些问题进行分类，基本确定造成畸形的病因和机制。第三步是确定治疗计划。明确治疗目标、目的、适应症、具体步骤和预测的效果。再次需要反复强调治疗所需要的时间、费用和治疗后可能存在的问题（即预后分析），并记录在病例中。诊断的基本过程如下：

1、一般资料
包括患者的主诉、既往病史、现病史、患者目前的全身状况，例如发育、营养、系统疾病、不良许观和心理反应。

2、临床检查
包括患者颜面部的检查，口腔正畸专科临床检查，以及特殊检查，例如X线片检查等。

3、综合性分析
包括模型分析，功能分析，X线头影分析，心理分析等。

4、诊断
一般诊断包括四个内容：
⑴列出问题。依照问题的主次、严重程度依次排列；
⑵畸形分类，包括Angle分类、病因分类等；
⑶导致畸形的机理。上颌骨发育不足、下颌骨发育过度、牙齿过度前倾等；
⑷引起错颌的因素，例如遗传、不良习惯及外伤等等。

如果一时不能明确诊断，可以先进行"诊断性治疗"，经过初步治疗后在确定诊断。